Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms