Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms