Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms