Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PROX2Q3B8N5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms