Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms