Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms