Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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