Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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