Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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ECM1Q16610 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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ECM1Q16610 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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ECM1Q16610 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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