Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms