Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms