Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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