Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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