Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
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SHROOM2Q13796 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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SHROOM2Q13796 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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