Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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