Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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