Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PWP1Q13610 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms