Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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