Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHAF1AQ13111 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms