Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms