Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRJQ12913 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRJQ12913 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRJQ12913 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRJQ12913 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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