Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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