Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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