Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF1AQ12756 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms