Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms