Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms