Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms