Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms