Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms