Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG7P83436 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG7P83436 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG7P83436 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms