Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL8P80075 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL8P80075 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL8P80075 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL8P80075 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL8P80075 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL8P80075 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL8P80075 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL8P80075 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL8P80075 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms