Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC13P55735 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms