Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms