Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERFP50548 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms