Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1P48651 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms