Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms