Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms