Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms