Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRHP20396 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRHP20396 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRHP20396 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRHP20396 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRHP20396 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRHP20396 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms