Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms