Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DMDP11532 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DMDP11532 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DMDP11532 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DMDP11532 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DMDP11532 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DMDP11532 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DMDP11532 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DMDP11532 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DMDP11532 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DMDP11532 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms