Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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