Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB1P08034 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB1P08034 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB1P08034 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB1P08034 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms