Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFP01375 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFP01375 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFP01375 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFP01375 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFP01375 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFP01375 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFP01375 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFP01375 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFP01375 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFP01375 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFP01375 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms