Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG7O95352 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms