Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms