Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLGNO14967 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms