Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms