Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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