Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms